當史酷比一伙駕船進入世界上最神秘的海域神奇的百慕大魔鬼三角時，恐怖事件接二連三地發生了！從被外星人監視到遇見試圖用大炮擊沉他們的幽靈海盜，離奇事件不斷涌現，令所有人膽戰心驚。正當情況變得越來越糟之時，幽靈海盜綁架了弗雷德的父母，并將他的母親變成了一個海盜！倘若史酷比和薛奇無法破解這個海上之謎，那么他們毫無疑問將成為百慕大的下一批受害者。